成立于2011年，是江西省临床重点专科，九江市中医妇儿质量控制中心单位。科室现有主任医师1名，副主任医师2名，主治医师3名，住院医师1人，其中硕士研究生3人。该科室在学科带头人胡代平的带领下发挥中医药优势，发展专科特长。10余年的临床实践中注重突出中医特色，中西结合，辨病与辨证相结合，逐步形成以小儿哮喘等呼吸系统疾病为优势，以小儿泄泻等脾胃疾病为特色，收治病种覆盖儿童性早熟、儿童矮小等儿内科疾病。2022年医院实行诊疗组负责制。其中程赵蓓组主攻小儿哮喘方向，临床中充分利用科室经验方“温宣颗粒”结合穴位贴敷诊治儿童哮喘疗效显著；李名球组主攻小儿泄泻方向，科室协定处方小儿“暖脐贴”、穴位微波等中医特色疗法临床广泛用于治疗儿童腹泻，功能性腹痛等消化系统疾病。