如孤独症谱系障碍、语言障碍、全面发育障碍等，对这些孩子来说，受影响已经不仅仅只是学业问题，还会影响到他们的家庭氛围、社交和独立生活问题及伙伴关系等，也会对他们的学校生活和成长造成困难，尤其需要关注高危儿童（如早产极低出生体重、缺氧病史、出生后脑损伤性疾病等）的发育及行为发展。

由神经发育问题造成的“学习困难”孩子中，ADHD是常见的情况。由于ADHD儿童神经功能发育不完善，在学习中总会遇到特有的、主观很难克服的困难，比如多动、无法集中注意力、马虎粗心、难以理解并学习新知识、感觉脑子总是转不过弯儿、无法完成相对复杂的任务等，从而限制了发展的潜能。他们的智力多数都是正常的，但是由于注意缺陷或者多动冲动症状持续的存在，会给学习带来一定的困难。

这是一种有脑神经生理基础的特定学习障碍，特征是难以准确地识别文字，并且拼写能力也较差，孩子可能从小学低年级开始就显示出在读写计算方面比较慢、比较累，常常完不成学校规定的作业量，刷题和罚抄很可能只会雪上加霜，让孩子产生厌烦恐惧和心理负担，进而加重学习困难。这种情况与智力无关，也可以没有明显的学习态度问题。

如分离焦虑、学校恐惧症、社交障碍、焦虑抑郁等，焦虑紧张、情绪低落的状态，会导致孩子的学习效率降低，学习成绩停滞不前甚至倒退，挫败感增强，遇到困难就失去信心。有些孩子在受到情绪困扰和成绩退步的双重打击后，可能会对学习丧失兴趣、沉迷网络游戏，与大人对抗，在很多家长、老师眼中，很容易与思想品德、个性问题相混淆，所以早期识别情绪，并帮助学习合理宣泄是关键。

有些疾病比如：过敏、鼻炎、甲低、肥胖、甲亢、癫痫及脑缺氧后遗症、维生素D缺乏、铅中毒、腺样体肥大、睡眠障碍等等，如果没有坚持合理科学治疗，综合疾病带给孩子的影响，同样会成为孩子学习路上的绊脚石，需要专科人员给予识别、转介、转诊及多学科协作提供诊疗。